MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid B

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010541	TAA	2	6	21	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010541	GAA	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034860
3	NC_010541	TAG	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034860
4	NC_010541	TAA	2	6	190	195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034860
5	NC_010541	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034860
6	NC_010541	CTT	2	6	291	296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034860
7	NC_010541	AAC	2	6	335	340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034860
8	NC_010541	GAT	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034860
9	NC_010541	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
10	NC_010541	CTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
11	NC_010541	AT	3	6	469	474	50 %	50 %	0 %	0 %	172034860
12	NC_010541	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034860
13	NC_010541	TCAGTT	2	12	544	555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172034860
14	NC_010541	T	6	6	560	565	0 %	100 %	0 %	0 %	172034860
15	NC_010541	GA	3	6	611	616	50 %	0 %	50 %	0 %	172034860
16	NC_010541	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034860
17	NC_010541	TCT	3	9	681	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034860
18	NC_010541	CTG	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
19	NC_010541	ACT	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034860
20	NC_010541	TTA	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034860
21	NC_010541	T	7	7	940	946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010541	TTA	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010541	T	8	8	1075	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010541	TGGT	2	8	1103	1110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010541	ATT	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010541	A	6	6	1158	1163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010541	TCT	2	6	1211	1216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010541	GAGC	2	8	1221	1228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010541	ATC	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010541	TTATTT	2	12	1343	1354	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010541	GAT	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010541	ATC	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034861
33	NC_010541	CCA	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034861
34	NC_010541	AGC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
35	NC_010541	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034861
36	NC_010541	CGA	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
37	NC_010541	CGG	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034861
38	NC_010541	AGC	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
39	NC_010541	TCAA	2	8	1950	1957	50 %	25 %	0 %	25 %	172034861
40	NC_010541	A	6	6	2029	2034	100 %	0 %	0 %	0 %	172034862
41	NC_010541	TGA	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034862
42	NC_010541	TAA	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034862
43	NC_010541	TCA	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034862
44	NC_010541	CAA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034862
45	NC_010541	A	8	8	2121	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	172034862
46	NC_010541	ATCT	2	8	2164	2171	25 %	50 %	0 %	25 %	172034862
47	NC_010541	CAA	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034862
48	NC_010541	TGAG	2	8	2228	2235	25 %	25 %	50 %	0 %	172034862
49	NC_010541	GATT	2	8	2398	2405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010541	A	6	6	2532	2537	100 %	0 %	0 %	0 %	172034863
51	NC_010541	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034863
52	NC_010541	TTG	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034863
53	NC_010541	T	6	6	2748	2753	0 %	100 %	0 %	0 %	172034864
54	NC_010541	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	172034864
55	NC_010541	ATA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034864
56	NC_010541	CTTA	2	8	2828	2835	25 %	50 %	0 %	25 %	172034865
57	NC_010541	A	7	7	2858	2864	100 %	0 %	0 %	0 %	172034865
58	NC_010541	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	172034865
59	NC_010541	CTG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034865
60	NC_010541	ACA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034865
61	NC_010541	C	6	6	3097	3102	0 %	0 %	0 %	100 %	172034866
62	NC_010541	CAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
63	NC_010541	GAC	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
64	NC_010541	GCT	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034866
65	NC_010541	CTAGGA	2	12	3309	3320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172034866
66	NC_010541	ATT	3	9	3454	3462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
67	NC_010541	CGG	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034866
68	NC_010541	AAT	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
69	NC_010541	TCT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
70	NC_010541	CCA	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
71	NC_010541	CCA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
72	NC_010541	GTG	2	6	3835	3840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
73	NC_010541	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
74	NC_010541	TTA	2	6	3970	3975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
75	NC_010541	TGG	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
76	NC_010541	A	6	6	4028	4033	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
77	NC_010541	TGA	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
78	NC_010541	ACC	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
79	NC_010541	ACCT	2	8	4207	4214	25 %	25 %	0 %	50 %	172034866
80	NC_010541	ACC	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
81	NC_010541	TTAA	2	8	4278	4285	50 %	50 %	0 %	0 %	172034866
82	NC_010541	ATGAAA	2	12	4300	4311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	172034866
83	NC_010541	GAC	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
84	NC_010541	GTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034866
85	NC_010541	TAT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
86	NC_010541	TC	3	6	4661	4666	0 %	50 %	0 %	50 %	172034866
87	NC_010541	AAAC	2	8	4742	4749	75 %	0 %	0 %	25 %	172034866
88	NC_010541	TAA	3	9	4778	4786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
89	NC_010541	GTG	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
90	NC_010541	TTA	2	6	4878	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
91	NC_010541	TGA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
92	NC_010541	TTAT	2	8	4899	4906	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
93	NC_010541	AAGG	3	12	4912	4923	50 %	0 %	50 %	0 %	172034866
94	NC_010541	A	6	6	4956	4961	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
95	NC_010541	TATT	2	8	5016	5023	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
96	NC_010541	T	6	6	5082	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	172034866
97	NC_010541	CTT	3	9	5090	5098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
98	NC_010541	TGAT	2	8	5104	5111	25 %	50 %	25 %	0 %	172034866
99	NC_010541	ATT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
100	NC_010541	TTAT	2	8	5165	5172	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
101	NC_010541	ATA	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
102	NC_010541	CTA	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
103	NC_010541	A	6	6	5508	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
104	NC_010541	AAAC	2	8	5534	5541	75 %	0 %	0 %	25 %	172034866
105	NC_010541	ATG	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
106	NC_010541	CCT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034866
107	NC_010541	GAA	2	6	5625	5630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034866
108	NC_010541	TACCT	2	10	5663	5672	20 %	40 %	0 %	40 %	172034866
109	NC_010541	TTAC	2	8	5762	5769	25 %	50 %	0 %	25 %	172034866
110	NC_010541	AGTT	2	8	5821	5828	25 %	50 %	25 %	0 %	172034866
111	NC_010541	A	6	6	6021	6026	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
112	NC_010541	GTT	2	6	6059	6064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034866
113	NC_010541	CT	3	6	6080	6085	0 %	50 %	0 %	50 %	172034866
114	NC_010541	ACG	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
115	NC_010541	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034866
116	NC_010541	AT	3	6	6253	6258	50 %	50 %	0 %	0 %	172034866
117	NC_010541	AAT	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
118	NC_010541	ATGG	2	8	6354	6361	25 %	25 %	50 %	0 %	172034866
119	NC_010541	TAC	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
120	NC_010541	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
121	NC_010541	GAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
122	NC_010541	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
123	NC_010541	TC	3	6	6796	6801	0 %	50 %	0 %	50 %	172034867
124	NC_010541	CAG	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034867
125	NC_010541	CAC	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034867
126	NC_010541	AATC	2	8	6903	6910	50 %	25 %	0 %	25 %	172034867
127	NC_010541	TTG	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034867
128	NC_010541	CAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034867
129	NC_010541	GGT	2	6	6975	6980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034867
130	NC_010541	CCAA	2	8	6994	7001	50 %	0 %	0 %	50 %	172034867
131	NC_010541	TTG	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034867
132	NC_010541	CAAA	2	8	7113	7120	75 %	0 %	0 %	25 %	172034867
133	NC_010541	GCT	2	6	7125	7130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034867
134	NC_010541	TCAG	2	8	7294	7301	25 %	25 %	25 %	25 %	172034868
135	NC_010541	TGA	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010541	TA	3	6	7456	7461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010541	GCTAG	2	10	7488	7497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010541	TAG	2	6	7598	7603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_010541	A	8	8	14680	14687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_010541	TAAA	2	8	14829	14836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010541	CAT	2	6	14882	14887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034874
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287	NC_010541	TAAT	2	8	15469	15476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010541	AATA	2	8	15559	15566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_010541	TGA	2	6	20784	20789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
400	NC_010541	TGC	2	6	20899	20904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034883
401	NC_010541	TTCG	2	8	20906	20913	0 %	50 %	25 %	25 %	172034883
402	NC_010541	CTG	2	6	20922	20927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034883
403	NC_010541	TGC	2	6	20935	20940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034883
404	NC_010541	GAT	2	6	20942	20947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034883
405	NC_010541	T	6	6	20981	20986	0 %	100 %	0 %	0 %	172034883
406	NC_010541	CGT	2	6	21050	21055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034883
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409	NC_010541	GGT	2	6	21109	21114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034883
410	NC_010541	ATTA	2	8	21215	21222	50 %	50 %	0 %	0 %	172034883
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425	NC_010541	TAA	2	6	22007	22012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_010541	T	6	6	22139	22144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_010541	TAA	2	6	22148	22153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_010541	AATT	2	8	22161	22168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_010541	ATT	3	9	22166	22174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_010541	TGT	2	6	22175	22180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_010541	TCAA	2	8	22236	22243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
432	NC_010541	ATG	2	6	22363	22368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034884
433	NC_010541	GAC	2	6	22394	22399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034884
434	NC_010541	CAG	2	6	22477	22482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034884
435	NC_010541	CTA	2	6	22495	22500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034884
436	NC_010541	TGA	2	6	22514	22519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034884
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